中国医学科学院肿瘤医院深圳医院是经国家卫健委（原国家卫计委）批准，由深圳市公立医院管理中心与肿瘤防治“国家队”——中国医学科学院肿瘤医院（国家癌症中心）共建的深圳市首家肿瘤专科医院。
医院用地面积96403㎡、建筑面积141288㎡，一期编制床位800张。二期第二住院大楼、科研教学楼等医疗建筑群体建成，总床位数将达到2000张。2018年中国医学科学院肿瘤医院深圳医院被评为“中国最美医院”，2022年医院将建成华南地区首个质子治疗中心。
中国医学科学院肿瘤医院深圳医院采用“一院两区”的运营模式，与中国医学科学院肿瘤医院共享技术、人才、学科建设等顶尖肿瘤专科医疗资源。作为深圳市政府医疗卫生“三名工程”重点建设项目，我院积极响应深圳市政府“三名工程”的政策要求，引进七个“三名工程”团队：中国医学科学院肿瘤医院赫捷院士胸部肿瘤创新团队、中国医学科学院肿瘤医院王绿化教授肿瘤放射治疗团队、中国医学科学院肿瘤医院孙燕院士中西医结合肿瘤治疗团队、中国医学科学院肿瘤医院孙莉教授癌痛治疗及肿瘤围术期医学团队、四川大学华西医院步宏教授肿瘤病理学团队、北京协议医院向阳教授妇科肿瘤综合治疗团队、英国伦敦大学学院Tariq Enver教授癌症精准医学研究团队。
医院秉承“团结奉献，敬业创新”这一理念，要求全体医护人员立足服务深圳，覆盖华南、面向港澳台、辐射东南亚，10年内把医院建设成为集医教研防为一体的国际化肿瘤专科医院，为我国的肿瘤防控和诊治事业做出贡献。