研究所以细胞分析中的科学技术的关键突破为基础，以关键基础生物学问题和人民健康重大问题为导向，现组建人才团队开展如下方向的研究工作：以新型蛋白质组学分析技术为代表的细胞分析新技术的研究；发展以微量细胞表征、操纵和处理为主的高通量自动化多组学分析技术；建设具有国际领先水平的细胞分析技术研究技术平台。研究所现有轨道阱超高分辨质谱仪、组织成像质谱仪等大型仪器设备。