始建于2000年，2023年底划转进入中交长江建设，与中交长江建设技术中心采用“一门两牌”运作模式，是中交长江建设科技创新、技术支撑与数字产业发展的核心平台。拥有电子与智能化工程专业承包二级、CMMI软件能力成熟度模型3级、水文水资源调查评价甲级等7项资质证书，主要承接数智产业、空天地水工一体化监测、科技创新研发、施工技术咨询服务、施工监测、水利发展研究、全过程造价咨询、水土保持监测等业务。重庆水科研究院秉持“智水润物 求是创新”的理念，推进“科技创新研发中心、技术服务咨询中心、数智产业发展中心、创新平台发展中心、科学技术交流中心、科技人才培养中心”六大平台建设，致力于成为中交集团水利业务领域“全数字”的探索者，努力打造“西部领先、全国进位，具有重庆辨识度”的专精特新高科技企业。