南京信息工程大学是国家“双一流”建设高校，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校办学特色鲜明，大气科学入选国家“世界一流学科”建设学科，在教育部近三轮学科评估中蝉联A+。
学校气象学为国家重点学科，地球科学、工程学、计算机科学、环境科学与生态学、化学、农业科学、材料科学、社会科学总论、数学等9个学科跻身ESI学科排名全球前1%，其中地球科学和计算机科学进入ESI全球排名前1‰。拥有大气科学、环境科学与工程、信息与通信工程、管理科学与工程、数学、科学技术史、计算机科学与技术、遥感科学与技术、光学工程、网络空间安全、生态学11个一级学科博士学位授权点，电子信息、资源与环境、气象3个博士专业学位授权点，28个一级学科硕士学位授权点，26个硕士专业学位授权点。拥有大气科学、数学、环境科学与工程、管理科学与工程、计算机科学与技术、信息与通信工程等6个博士后科研流动站。80个本科专业（不含专业方向）分布于理、工、文、管、经、法、农、艺、教9个学科领域。